تفاوت این دو در دمای آنها ، در چگالی و ضریب پرشدگی آنهاست اتمهای فوق سرد دمایشان از مرتبه میکروکلوین است و چگالی آنها از مرتبه۱۰۱۰ بر سانتی متر مکعب می باشد در حالی که BEC دمایش از مرتبه نانوکلوین (یعنی هزار برابر سردتر ) و چگالی آن ۱۰۱۴ بر سانتی متر مکعب است ( یعنی ده هزار بار چگالتر ) همچنین ضریب پرشدگی این دو با هم متفاوت است به طوری که در شبکه های اپتیکی حاوی اتمهای فوق سرد تعداد تهی جاها ( چاههای شبکه )  خیلی زیاد است مثلاً شانه تخم مرغی را تصور کنید که تعداد زیادی از خانه های آن خالی است و این در حالی است که در شبکه های اپتیکی حاوی BEC تقریبا تمام تهی جاها (چاههای شبکه ) پر شده است مثلاً شانه تخم مرغی را تصور کنید که تقریبا همه خانه های آن پر است.